r语言gsea分析

接下来为大家讲解r语言go分析图，以及r语言gsea分析涉及的相关信息，愿对你有所帮助。

简述信息一览：

• 1、数据分析图表怎么做
• 2、生存分析R语言绘图——ggsuvplot介绍及实例
• 3、【R语言】解决GO富集分析绘图,标签重叠问题
• 4、怎么用origin做go分析图
• 5、R语言:clusterProfiler进行GO富集分析和Gene_ID转换

数据分析图表怎么做

1、打开表格打开Excel，输入数据，创建表格。插入图表选中整个表格，点击菜单栏上”插入-推荐的图表“。选择图表类型点击所有图表，选择柱形图。修改标题点击图表标题，修改图表标题，数据分析图表制作完成。

2、首先我们打开ppt，点击顶上菜单【插入】。 接着点击选择【图表】。 选择要做数据分析的图，点击【插入】。 接着我们用鼠标右键点击图表，选择【编辑数据】。 然后编辑数据，点击左上角的按钮【保存】即可。

3、确定数据分析目的和对象 在制作数据分析图表时，需要根据数据的特点和分析目的，设置图表的样式和参数。比如，可以设置图表的颜色、字体、标题、图例、坐标轴等等。

4、选中数据区域——点击插入——选择所需图表类型，然后进入图表美化。点击图表工具——格式——垂直（值）轴——设置所选内容格式。垂直（值）轴：设置坐标轴格式——坐标轴选项。

5、在 PowerPoint 中，制作数据分析图的方法主要有两种：使用 PowerPoint 的图表功能 使用 PowerPoint 的图表功能可以快速创建各种类型的数据分析图。具体步骤如下：1）在 PowerPoint 中打开或新建一个幻灯片。

生存分析R语言绘图——ggsuvplot介绍及实例

1、surv.median.line = none， #画一条水平或者垂直得生存中位值线，允许的值有c（none， hv， h， v）. v： 垂直vertical， h：水平horizontal.risk.table = FALSE， #是否显示风险table。

2、然后我们进行生存曲线的分析，使用futime和fustat两列，首先根据是否发生删失对数据进行处理。 可以看到发生删失的都带上了加号。

3、《R语言经典实例》是2013年出版的一本图书，该书作者是Paul Teetor。该书主要介绍了本书涵盖200多个R语言实用方法，可以帮助读者快速而有效地使用R进行数据分析。

4、反正你就记住一个例子，我要研究汽车发生故障，我也应该用生存分析，因为我既关心是不是有故障，我还关心用了多久（跑了多远）才出故障，就是既有time，又有event，Time-to-event data就用生存分析。

【R语言】解决GO富集分析绘图,标签重叠问题

1、最近有粉丝反映说，利用clusterProfiler这个包绘制GO富集分析气泡图和柱形图的时候，发现GO条目的名字都重叠在一起了。气泡图 柱形图 这个图别说美观了，简直不忍直视。经过我的认真研究，发现跟R版本有关。

2、在是否需要构建的问题上，我看到徐洲更在 功能注释后如何做富集分析 中提到 “你不需要构建Orgdb，因为Orgdb的用途是进行基因编号和GO/KEGG的转换。

3、r语言怎么查看富集分析的数据 首先利用r语言的install中的packages方法，输入参数【xlsx】即可。此时利用library（xlsx）语句，打开xlsx这个库。此时通过read的xlsx语法就能读取某个文件夹下的Excel文件。

怎么用origin做go分析图

1、方法一：原始数据法 1 分别打开origin，然后找到两张origin图的数据，将两个或多个数据通过***粘贴放到一个Date数据框中。2 选中数据，右键——Set as——XY XY，设置横纵坐标。3 点击作图界面左下角的Line作图。

2、首先打开origin，输入数据。然后做出曲线图。 要在Origin中显示曲线图例，请按照以下步骤操作：在Origin菜单栏中选择“Data”“LineProperties”。在弹出的“LineProperties”对话框中，选择“Legends”标签。

3、打开Origin绘图软件。在“Date1”界面右键，选择“Addnewcolumn”，添加新的Y轴。在“Date1”界面中输入数据。选中数据区域，点击左下角“line+symbol”按钮，绘制出数据图。

R语言:clusterProfiler进行GO富集分析和Gene_ID转换

检查结果，可见geneID展示为gene symbol。（1）在enrichGO函数中，设置readable = TRUE；（2）用setReadable函数，对GO或者KEGG结果进行转化即可。

对于没有转换的gene ID，clusterProfiler也提供了 bitr 方法进行转换ID：可以看到，这里转换ID的对应文件来源于org.Hs.eg.db这个包。

你可以直接导入基因号和GO/KEGG编号的对应关系到R里面，然后用clusterProfiler进行数据分析” 。在如何构建的问题上，网上也有许多文章进行了介绍。构建 OrgDb 时，需要 gene_info 和 gene2go 。

最近有粉丝反映说，利用clusterProfiler这个包绘制GO富集分析气泡图和柱形图的时候，发现GO条目的名字都重叠在一起了。气泡图 柱形图 这个图别说美观了，简直不忍直视。经过我的认真研究，发现跟R版本有关。

第一列为GO term的ID，点击GO ID，可显示这个GO term包含的所有基因：再点击这个GO ID，就可以链接到 http：//amigo.geneontology.org ***，可以查看GO的具体信息。

clusterProfiler是一个功能强大的R包，同时支持GO和KEGG的富集分析，而且可视化功能非常的优秀，本章主要介绍利用这个R包来进行Gene Ontology的富集分析。

关于r语言go分析图，以及r语言gsea分析的相关信息分享结束，感谢你的耐心阅读，希望对你有所帮助。